단백질의약품의 배양을 위해 작업지시서를 확인하고 냉동된 세포주를 냉동탱크(액체질소탱크)에서 꺼내 상온수조에서 해동시킨다. 세포주 배양을 위해 플라스크(Flask)에 배지를 넣고 해동된 세포주를 접종한다. 인큐베이터(Incubator)에 온도, 습도 등의 배양조건을 입력하고 플라스크 넣어 일정 시간 배양한다. 배양 단계에 따라 웨이브 세포배양기(Wave Bioreactor)를 사용하여 배양시키기도 한다. 종배양기(Seed Bioreactor)기 내부를 고온의 순수로 살균하고 배지와 순수를 공급하고 온도, 습도, 산도(pH), 교반속도(rpm) 등의 배양조건을 입력한 뒤 플라스크에서 배양된 세포주를 종배양기에 넣어 일정 시간 배양한다. 배양체적 증가 속도에 따라 배양기의 용량을 늘려가며 본배양기(Production Bioreactor)로 이동시킨다. 세포 배양 중 세포량에 따라 배지와 각종 영양물질, 순수의 공급과 온도, 습도, 산도(pH), 교반속도(rpm), 세포주의 대사물질 등을 모니터링하고 기록한다. 일정 시간마다 샘플을 채취하여 세포수 및 생존율을 구하고 단백질관련 시험분석을 실시한다. 주배양이 완료된 배양액을 원심분리나 필터처리하여 목표 단백질이 포함된 분리회수액을 회수한다.