제조하고자 하는 제품에 따른 배합비를 확인한 후, 자동계량용기나 저울을 사용해 원료(주정, 포도당, 청주박)를 계량한다. 배합탱크에 계량한 원료를 투입하고 일정량의 물을 넣은 후, 배합이 용이하도록 교반기를 작동시킨다. 배합이 완료되면 탱크의 배출밸브를 열고 펌프를 가동하여 발효탱크로 배합액을 이송한다. 실험실에서 제조한 효모를 배합액에 접종(接種)하고 교반기를 가동한다. 증기밸브, 냉각수밸브, 송풍기 등을 사용하여 발효탱크의 온도를 일정하게 유지시킨다. 배합이 완료된 배합액을 숙성탱크로 이송하여 일정 시간 동안 숙성시킨 후 여과망이 부착된 여과기에 주입하여 배합액과 균체를 분리한다. 여과된 식초의 견본을 채취하여 산도(초 속에 포함되어 있는 각종 유기산의 산미성분 비율)를 검사하고 펌프를 가동하여 완성조 탱크로 이송한다. 산도를 제품규격에 맞추기 위하여 급수밸브를 돌려 일정 비율의 물을 주입한다. 초산균 및 기타 유해균을 살균하고자 열교환기를 통과시킨다. 살균온도와 인출온도를 확인하며 스팀을 사용할 때는 스팀압력과 가압변화, 자동컨트롤러의 이상 유무를 확인·점검한다. 펌프를 가동하여 저장탱크로 이송한다.