단백질의약품을 만들기 위해 배양 후 원심 분리나 필터를 거친 분리회수액에서 기타 단백질, 불순물 등을 분리하여 목표 단백질을 회수농축하기 위해 크로마토그래프(Chromatography)와 한외여과/투석여과(UF/DF:Ultrafiltration/Diafiltration), 바이러스필터시스템을 조작한다. 정제조건에 따라 크로마토그래프의 컬럼컨트롤러(Column Controller)에 정제시간, 온도, 버퍼의 종류, 정제순서 등의 정제조건을 입력하고 컬럼에 레진을 충진시킨 후 버퍼를 주입하고 예열한다. 분리회수액을 컬럼에 주입하여 순차적으로 정제한다. 정제된 용출액을 적정농도로 농축하기 위해 한외여과/투석여과(UF/DF:Ultrafiltration/Diafiltration)를 수행하고 안정화 버퍼(Buffer)에 정착시킨다. 멤브레인(Membrane) 크로마토그래프나 필터를 이용하여 내부의 바이러스를 제거하기도 한다. 각 과정의 샘플을 채취하여 시험검사를 의뢰하고, 공정조건과 과정을 기록한다. 정제/농축이 완료된 치료단백질은 보관용기에 보관한다.